Michael Fassbender, 2 Nisan 1977 tarihinde Almanya'nın Heidelberg şehrinde doğdu. Babası Alman, annesi ise Kuzey İrlandalıdır. Ailesiyle daha sonra Kuzey İrlanda'ya taşındı ve Fassbender büyük ölçüde orada büyüdü. Genç yaşlarda oynadığı tiyatro oyunundan sonra oyuncu olmak istediğini fark etti.
Fassbender, drama okumak için Londra'ya gitti. Kariyerine tiyatro ve televizyon dizilerinde küçük rollerle başladıktan sonra, "300" filmindeki küçük bir rolle dikkat çekti.
2008 yılında "Hunger" filmindeki rolüyle büyük çıkışını gerçekleştirdi. Filmde, 1981 yılında IRA mensubu Bobby Sands'in hapishanede yaşadığı açlık grevini konu alıyordu ve Fassbender bu rolüyle büyük övgü aldı. Bu başarı, onun daha geniş tanınmasını sağladı.
Ardından "Inglourious Basterds" (2009), "Jane Eyre" (2011), "X-Men: First Class" (2011), "Prometheus" (2012) gibi önemli yapımlarda yer aldı. 2013 yılında "12 Years a Slave" filmindeki rolüyle En İyi Yardımcı Erkek Oyuncu dalında Akademi Ödülü'ne aday gösterildi.
Michael Fassbender, "Steve Jobs" (2015) filmindeki performansıyla da büyük takdir topladı ve bir kez daha Akademi Ödülü'ne aday gösterildi. Kariyeri boyunca birçok farklı türde filmde rol alarak çok yönlülüğünü kanıtladı.
Fassbender, aynı zamanda "X-Men" serisindeki Magneto karakteriyle tanınmaktadır. Oyunculuğu, dikkat çekici performansları ve uluslararası projelerdeki başarısıyla dünya çapında tanınan bir aktör olarak kariyerini sürdürmektedir.
2010 yılında Fassbender, "Shy " filmindeki rol arkadaşı İngiliz aktris Nicole Beharie ile ilişki yaşamaya başladı. Ancak, ilişkileri kısa bir süre sonra sona erdi.
2016 yılında, " The Light Between Oceans " filmindeki rol arkadaşı İsveçli aktris Alicia Vikander ile ilişki yaşamaya başladı. Çift, genellikle özel hayatlarını koruma konusunda titiz davranmış ve medyadan uzak tutmaya çalışmıştır. 2017 yılında gizlice evlendikleri rapor edildi. Daha sonra düğünleri İtalya'da doğrulandı.