Engin Alan, 31 Mart 1945'te Üsküdar, İstanbul'da dünyaya geldi. Kara Harp Okulu mezunu olan Alan, Türk Silahlı Kuvvetleri'nde uzun yıllar çeşitli birliklerde görev yapmıştır. 1974 Kıbrıs Harekâtı'nda görev aldıktan sonra kariyerinde yükselmiş ve 1992'de tuğgeneral rütbesine terfi etmiştir.
1999 yılında Türk Özel Kuvvetler Komutanı olarak görev yaparken, PKK lideri Abdullah Öcalan'ın ABD destekli uluslararası operasyonla yakalanmasında önemli rol oynamıştır. Emekli olduktan sonra Türk Silahlı Kuvvetlerini Güçlendirme Vakfı Genel Müdürlüğü görevini üstlenmiştir.
Siyasi hayatına 2011 Türkiye genel seçimlerinde Milliyetçi Hareket Partisi'nden (MHP) İstanbul milletvekili olarak seçilerek adım atan Alan, 2010 yılında Balyoz davasından tutuklanmış ve 2012'de 28 Şubat süreci soruşturması kapsamında tekrar tutuklanmıştır.
Balyoz davasında suçlu bulunarak hapis cezasına çarptırılan Engin Alan, 2014 yılında Anayasa Mahkemesi'nin gerekçeli kararı doğrultusunda tahliye edilmiştir. 2014 Türkiye genel seçimlerinde MHP İstanbul milletvekili olarak TBMM'ye giren Alan, 4,5 yıl hapis yattıktan sonra açtığı tazminat davasında toplam 1 milyon 363 bin TL tazminat kazanmıştır.
16 Ekim 2020 tarihinde organize suç örgütü lideri Alaattin Çakıcı, eski bakan Mehmet Ağar ve emekli asker Korkut Eken ile Yalıkavak Marina'da buluşan Engin Alan'ın bu buluşma kamuoyunda dikkat çekmiştir.
